BIO9210 - Fylogeni og klassifikasjon
Kort om emnet
Emnet gir en oversikt over forskningsmetodikk innen moderne systematikk med vekt på fylogenetisk analyse basert på molekylære data. Ulike tilnærminger til fylogenetisk analyse vil bli gjennomgått: distansemetoder, parsimoni, nettverksalgoritmer, maximum likelihood og bayesiansk analyse. Koblingen mellom fylogeni og klassifikasjon samt en kort innføring i nomenklatoriske prinsipper vil likeledes inngå.
Hva lærer du?
Studentene vil oppnå bakgrunnskunnskap om fylogenetisk teori samt kjennskap til ulike analyseverktøy som gjør dem i stand til å analysere ulike typer data og tolke resultatene i en større sammenheng.
Opptak og adgangsregulering
Ph.d.-kandidater ved UiO søker plass på undervisningen og melder seg til eksamen i StudentWeb.
Hvis emnet har begrenset kapasitet, vil ph.d.-kandidater som har emnet i sin utdanningsplan ved UiO bli prioritert. Noen nasjonale forskerskoler kan ha egne regler for rangering av søkere til emner med begrenset kapasitet.
Ph.d.-kandidater som har opptak ved andre utdanningsinstitusjoner må innen angitt frist søke om hospitantplass.
Forkunnskaper
Anbefalte forkunnskaper
Det er en fordel (men ikke nødvendig) at BIO4200 - Molekylær evolusjon/BIO9200 - Molekylær evolusjon tas parallelt.
Overlappende emner
10 studiepoeng overlapp mot BIO4210 - Fylogeni og klassifikasjon.Undervisning
Undervisningen vil bli organisert i forelesninger og dataøvelser hvor studentene kan jobbe enkeltvis eller i små grupper. Det er obligatorisk oppmøte på første forelesning.
Eksamen
Obligatorisk innlevering basert på dataøvelsene vurderes (bestått/ikke bestått) og må være bestått for å kunne gå opp til avsluttende eksamen. Kandidatene skal også holde en 45 minutter forelesning om et tema som er relevant for kurset, men som enten bare kort berøres i de faste forelesningene eller ikke i det hele tatt. Tema bestemmes av emneansvarlig og PhD-studenten i samråd. Avsluttende skriftlig eksamen: 3 timer, teller 100%.
Karakterskala
Emnet bruker karakterskala bestått/ikke bestått. Les mer om karakterskalaen.
Begrunnelse og klage
Du kan be om begrunnelse for eksamenskarakterene, og du kan klage over karakterfastsettingen eller over formelle feil ved eksamen. Les mer om begrunnelse og klage.
Adgang til ny eller utsatt eksamen
Dette emnet tilbyr ny eksamen i begynnelsen av påfølgende semester til kandidater som stryker eller trekker seg under ordinær eksamen.
For nærmere opplysninger, se reglement for utsatt og ny eksamen ved MN-fakultetet
Studenter som pga gyldig frafall (sykdom o.l.) ikke har kunnet gjennomføre ordinær eksamen, kan søke om å få avlegge utsatt eksamen. Utsatt eksamen arrangeres enten senere i samme semester eller tidlig i semesteret etter ordinær eksamen. Dokumentasjon på gyldig fravær må legges ved søknad om utsatt eksamen, jf §5.5 i Forskrift om studier og eksamener ved UiO
Trekk fra eksamen
Det er mulig å ta eksamen i emnet inntil tre ganger. Dersom du trekker deg fra eksamen etter fristen eller under eksamen, bruker du et eksamensforsøk.
Tilrettelagt eksamen
En student som har en funksjonshemning og/eller kroniske eller akutte helseproblemer som fører til vesentlige ulemper i eksamenssituasjonen i forhold til andre studenter, kan søke om tilrettelegging ved eksamen. Mødre som ammer kan søke om tilleggstid på eksamen.
Evaluering av emnet
Tilbakemelding fra studentene våre er avgjørende for at vi skal kunne tilby best mulige emner og studieprogrammer. Vi gjennomfører fortløpende evaluering av dette emnet, og med jevne mellomrom ber vi studentene delta i en mer omfattende, periodisk evaluering av emnet.