BIOS1100 – Innføring i beregningsmodeller for biovitenskap

Kort om emnet

Vi kan ofte forstå mer av en kompleks virkelighet ved å undersøke forenklede modeller av den. Dette emnet gir en innføring i å lage og eksperimentere med enkle modeller av biologiske systemer. Datamaskinen og programmeringsspråket Python blir brukt for å lage et virtuelt biologisk laboratorium for å finne svar på spørsmål hentet fra genetikk, evolusjon, økologi og bioinformatikk.

Hva lærer du?

Etter å ha fullført dette emnet

• kan du grunnleggende Python-programmering med bruk av utvalgte datastrukturer, funksjoner og moduler, samt løkker og betingelsestester
• kan du organisere biologiske data, lese og skrive slike data til og fra fil og lage grafiske framstillinger
• kan du modellere enkle biologiske systemer, matematisk og ved hjelp av programmering
• kan du dokumentere, presentere og formidle modeller av enkle biologiske systeme

Opptak til emnet

Studenter må hvert semester søke og få plass på undervisningen og melde seg til eksamen i Studentweb.

Spesielle opptakskrav

I tillegg til generell studiekompetanse eller realkompetanse må du dekke spesielle opptakskrav.

Du må ha:

• Matematikk R1 (eller Matematikk S1 + S2)

Og en av disse:

• Matematikk R2
• Fysikk (1+2)
• Kjemi (1+2)
• Biologi (1+2)
• Informasjonsteknologi (1+2)
• Geofag (1+2)
• Teknologi og forskingslære (1+2)

Matematikk R2 var et krav til og med studieåret 2021/2022 som del av en forsøksordning. Fra og med studieåret 2022/2023 er det ikke lenger et krav med matematikk R2.

De spesielle opptakskravene kan også dekkes med fag fra videregående opplæring før Kunnskapsløftet, eller på andre måter. Les mer om spesielle opptakskrav.

Overlappende emner

• 7 studiepoeng overlapp med GEO1040 – Grunnkurs i programmering for geofaglige problemstillinger (nedlagt).
• 7 studiepoeng overlapp med GEO-KJM1040 – Grunnkurs i programmering for problemstillinger i geofag og i kjemi (nedlagt).
• 7 studiepoeng overlapp med IN1900 – Introduksjon i programmering for naturvitenskapelige anvendelser.
• 7 studiepoeng overlapp med INF1100 – Grunnkurs i programmering for naturvitenskapelige anvendelser (videreført).
• 7 studiepoeng overlapp med IN-KJM1900 – Introduksjon i programmering for kjemikere.
• 7 studiepoeng overlapp med IN-GEO1900 – Introduksjon i programmering for geofagstudenter.
• 6 studiepoeng overlapp med IN1000 – Introduksjon til objektorientert programmering.
• 5 studiepoeng overlapp med MAT-IN1105 – Programmering, modellering og beregninger.
• 5 studiepoeng overlapp med MAT-INF1100L – Programmering, modellering og beregninger (videreført).
• 5 studiepoeng overlapp med JUS5080 – Programming for Lawyers.
• 5 studiepoeng overlapp med JUR1080 – Programming for Lawyers (nedlagt).
• 4 studiepoeng overlapp med INF1000 – Grunnkurs i objektorientert programmering (videreført).
• 4 studiepoeng overlapp med INF1001 – Grunnkurs i objektorientert programmering (nedlagt).

Undervisning

Ukentlig undervisning består av:

• Forelesning

• Samkoding

• Organisert øving i gruppe med hjelpelærer (obligatorisk)

• Åpen time: jobbe med oppgavene med hjelpelærere til stede

Se forøvrig timeplan på semestersiden.

Obligatoriske oppgaver må være godkjent og obligatoriske oppmøter må være gjennomførte for å kunne gå opp til eksamen.

Godkjent obligatorisk undervisning er gyldige i fem år.

Det er obligatorisk oppmøte til første forelesning. Dette gjelder også for de som er på venteliste. Du mister plassen på emnet dersom forfall til første forelesning ikke er meldt til studieseksjonen studieinfo@ibv.uio.no, før forelesningen starter.

Det kreves innlevering av obligatoriske oppgaver.

Adgang til undervisning

Dersom du har gjennomført og fått godkjent obligatorisk undervisning, har du ikke krav på ny undervisning. Dersom du har fått undervisningsopptak til emnet, men ikke har gjennomført eller fått godkjent obligatorisk undervisning, har du rett til ny undervisning når det er ledig kapasitet.

Eksamen

Avsluttende skriftlig eksamen som teller 100% ved sensurering.

Obligatoriske oppgaver må være godkjent og obligatoriske oppmøter må være gjennomførte for å kunne gå opp til eksamen.

Hjelpemidler til eksamen

Noen hjelpemidler gis tilgang til under eksamen.

Eksamensspråk

Eksamensoppgaven gis kun på bokmål. Du kan besvare eksamenen på norsk, svensk, dansk eller engelsk.

Karakterskala

Emnet bruker karakterskala fra A til F, der A er beste karakter og F er stryk. Les mer om karakterskalaen

Adgang til ny eller utsatt eksamen

Dette emnet tilbyr både utsatt og ny eksamen. Les mer:

• Syk på eksamen / utsatt eksamen
• Trekk under eksamen / ta eksamen på nytt

Mer om eksamen ved UiO

• Kildebruk og referanser
• Tilrettelegging på eksamen
• Trekk fra eksamen
• Syk på eksamen / utsatt eksamen
• Begrunnelse og klage
• Ta eksamen på nytt
• Fusk/forsøk på fusk

Andre veiledninger og ressurser finner du på fellessiden om eksamen ved UiO.