• Studier
• Emner
• Matematikk og naturvitenskap
• Informatikk
  • INF4350

INF4350 - Grunnkurs i bioinformatikk

Kort om emnet

Emnet gir en innføring i sentrale begreper og metoder innen
bioinformatikk. Det vil være lagt vekt på gjennomgang av effektive algoritmer og teknikker som benyttes i aktuelle programmer for analyse av genetiske sekvenser. Temaer som behandles vil være: sammenligning og sammenstilling av to eller flere sekvenser, indeksering av og søking i sekvensdatabaser, mønsteroppdaging, søking med sekvensmønstre, genprediksjon, samt mappping og "assembly" av data fra genomsekvensering. Elementær kunnskap i molekylærbiologi vil bli formidlet underveis.

Hva lærer du?

Deltagerne skal få oversikt over grunnleggende begreper i bioinformatikk og kjenne noen av de viktigste metodene og programverktøyene innenfor fagfeltet. De skal få tilstrekkelig innsikt i metodene og verktøyene til at de kan anvende dem på egne problemer.

Opptak og adgangsregulering

Studenter må hvert semester søke plass på undervisningen og melde seg til eksamen i StudentWeb.

Dersom du ikke allerede har studieplass ved UiO, kan du søke opptak til våre studieprogrammer eller søke om å bli enkeltemnestudent.

Det er ikke mulig å ta dette emnet som privatist. Du må ha plass på undervisningen for å ta eksamen.

Forkunnskaper

Anbefalte forkunnskaper

Emnet bygger på INF1000 - Grunnkurs i objektorientert programmering

Overlapping

9 studiepoeng mot INF325. 10 studiepoeng mot INF2300 - Grunnkurs i bioinformatikk. 10 studiepoeng mot INF3350 - Grunnkurs i bioinformatikk. 10 studiepoeng mot INF5330 - Bioinformatikk.

Undervisning

2 timer forelesning og 2 timer gruppeøvelser per uke.

Vurdering og eksamen

Karakter vil bli gitt på grunnlag av 2 deleksamener som teller 15% hver, og en avsluttende 4 timers skriftlig eksamen som teller 70%. Strykkarakter på en deleksamen gir likevel mulighet til å gå opp til de resterende eksamenene. Alle eksamener må gjennomføres i samme semester. Generell informasjon om eksamen.

Sensur

Emnet bruker gradert bokstavkarakterskala fra A til F, der A er beste karakter og F er stryk. Les mer om karakterskalaen .

Adgang til utsatt eller ny eksamen/vurdering

Dette emnet tilbyr ikke ny eksamen i begynnelsen av påfølgende semester til kandidater som stryker eller trekker seg under ordinær eksamen. For generelle opplysninger om ny og utsatt eksamen, se http://www.mn.uio.no/studier/admin/eksamen/utsatt-og-ny-eksamen/index.html

Trekk fra eksamen og antall eksamensforsøk

Ved praktisering av 3-gangers regelen skal emnet sees i sammenheng med INF325.

En student kan fremstille seg til eksamen i dette emnet inntil tre ganger. Studenten anses å ha fremstilt seg til eksamen dersom hun/han ikke har trukket eksamensmeldingen sin i StudentWeb innen en gitt frist.

Annet

Det er sterkt anbefalt å møte på første forelesning fordi det vil bli gitt viktig informasjon.

Kontakt oss