MBV3070 - Bioinformatikk
|
||||||||||||||
|
||||||||||||||
Kort om emnet
Biologiske sekvensdatabaser. Parvise sekvenssammenstillinger, flersekvenssammenstillinger, analyse av genomiske DNA-sekvenser, proteinmodellering, DNA-mikromatriser, enkel innføring i perl-programmering.
Hva lærer du?
Forståelse av hvordan sammenligning av biologiske sekvenser kan gi informasjon om funksjon og evolusjon av sekvensene. Virkemåten til algoritmer for optimale parvise sekvenssammenstillinger og for søk i sekvensdatabasene. Kjennskap til verktøy for homologibasert modellering av tredimensjonelle proteinstrukturer. Prinsipper for DNA-mikromatriser og analyse av resultatene fra slike. Kjennskap til hvordan perl kan brukes for konstruksjon og modellering av programmer for bioinformatisk analyse.
Opptak og adgangsregulering
Studenter må hvert semester søke plass på undervisningen og melde seg til eksamen i StudentWeb.
Dersom du ikke allerede har studieplass ved UiO, kan du søke opptak til våre studieprogrammer eller søke om å bli enkeltemnestudent.
Forkunnskaper
Obligatoriske forkunnskaper
MBV1030 - Generell biokjemi eller tilsvarende. MBV2010 - Molekylærbiologi eller tilsvarende. (MBV 2010 vil være obligatorisk forkunnskap fra 2008.)
I tillegg til generell studiekompetanse eller realkompetanse må du dekke spesielle opptakskrav:
En av disse:
- Matematikk R1
- Matematikk (S1+S2)
Og en av disse:
- Matematikk (R1+R2)
- Fysikk (1+2)
- Kjemi (1+2)
- Biologi (1+2)
- Informasjonsteknologi (1+2)
- Geofag (1+2)
- Teknologi og forskningslære (1+2)
De spesielle opptakskravene kan også dekkes med fag fra videregående opplæring før Kunnskapsløftet, eller på andre måter. Les mer om spesielle opptakskrav.
Anbefalte forkunnskaper
MAT1000 - Matematikk i praksis I. MBV2010 - Molekylærbiologi (obligatorisk forkunnskap fom våren 2008).
Overlapping
Emnet kan overlappe med emner som har vært undervist 2003 vår og tidligere.
Undervisning
Emnet vil strekke seg over et helt semester. Forelesninger 24 timer, arbeid på PC-stue 48 timer. PC-stueoppgavene er obligatoriske. Utvalgte PC-stueoppgaver vil inngå i en mappe som vil bli vurdert.
Vurdering og eksamen
Mappevurdering av utvalgte PC-stueoppgaver (ca 25% vekting). En skriftlig avsluttende 3 timers eksamen (juni) (ca 75% vekting). Ingen tillatte hjelpemidler. Endelig karakter fastsettes etter en helhetsvurdering. Bokstavkarakterer (A-F).
Dette emnet tilbyr ny eller utsatt eksamen i begynnelsen av påfølgende semester til kandidater som stryker eller trekker seg under ordinær eksamen eller som har gyldig fravær på ordinær eksamen.
Mer informasjon om eksamen finner du på fakultetets eksamenssider
Evaluering av emnet
Tilbakemelding fra studentene våre er avgjørende for at vi skal kunne tilby best mulige emner og studieprogrammer. Som student ved UiO vil du derfor bli bedt om å delta i ulike typer evaluering av studiehverdagen din. Vi gjennomfører fortløpende evaluering av dette emnet, og med jevne mellomrom ber vi studentene delta i en mer omfattende og detaljert evaluering, en såkalt "periodisk evaluering" av emnet.
Sentral side om kvalitetsystemet
Kontakt oss
Institutt for molekylær biovitenskap
Besøksadresse:
Kristine Bonnevies hus, Blindernveien 31
Ekspedisjonstid:
Tirsdag-torsdag 12:15-15:00
Postadresse:
Postboks 1041, Blindern
0316 Oslo
Faks: 22 85 60 41
E-post: studieinfo@imbv.uio.no
Web: http://www.mn.uio.no/imbv/