Identification of mutational subtypes in lung cancer

In this project, we will apply the computational tool SAMBAR to a lung cancer dataset from the Veteran Associates (VA), United States. SAMBAR was developed in our laboratory. The tool de-sparsifies gene mutation data into biological pathway mutation scores, and then clusters these data to identify cancer subtypes. We will link these subtypes to clinical data to determine if certain mutational patterns are associated with patient outcome and other clinical features.

TSD

  • Nei

Biobank

  • Nei

Godkjenninger

REK - Ja 1 fil

Disse dokumentene er kun synlige for prosjektleder, enhetens leder og forskningsadministrasjon.

Tidspunkt for anonymisering og sletting av dataene

  • Anonymisering: oktober 2019
  • Sletting: september 2022

Prosjektleder / prosjektansvarlig ved UiO

Marieke Kuijjer

Ansvarlig enhet

Norsk Senter for Molekylærmedisin

Forskere

  • Tatiana Belova
  • Camila Lopes-Ramos (Harvard Chan School of Public Health)

Prosjekttype

  • Forskerprosjekt

Helsefaglig forskning

  • Ja

Personopplysninger

  • Nei

Tidsperiode

  • Start: oktober 2019
  • Slutt: september 2022