Beskjeder

Publisert 24. jan. 2018 13:49

Løsningsforslag for konteeksamen (22. januar) er lagt ut på Jupyterhub. Filen heter konteeksamen.solutions.ipynb.

Sensurveiledningen og poenggrenser kommer senere.

Publisert 22. des. 2017 20:43

Løsningsforslag for eksamen samt sensurveiledning er lagt ut på Jupyterhub. Filen heter eksamen.exercises.solutions.ipynb.

Poenggrenser (maks 83 poeng):

A    75
B    65
C    51
D    42
E    33

(legg merke til at det for oppgaven 13 ble tildelt maks 3 poeng i stedet for 5, og at dermed maks poengsum for hele eksamen ble 83 i stedet for 85)

Publisert 9. des. 2017 15:57

IT har funnet årsaken og Jupyterhub er opp igjen! Beklager igjen at dette skjedde.

Legg merke til at løsninger til obliger er ute, de ligger i en egen mappe på Jupyterhub.

Publisert 8. des. 2017 13:53

Det har på nytt oppstått problemer med Jupyterhub, og det er visst vanskelig å finne årsaken. Dette må vi bare beklage på det sterkeste, sånt skal ikke skje såpass kort før deres eksamen.

Inntil disse problemene er løst kan dere allikevel jobbe med notebooks hvis dere følger disse instruksjonene:

1) (OPPDATERT) Laste ned alle dine notebooks via https://selfadmin.jupyterhub.uio.no. Du må logge inn med UiO brukernavn og passord. Når filen er lastet ned må du 'pakke den ut'.

2) Installere Anaconda som beskrevet her: https://www.uio.no/studier/emner/matnat/ibv/BIOS1100/h17/ressurser/install.md. Dette gir deg tilgang til Jupyter Notebooks. Naviger til mappen med kursets notebooks og da kan du åpne dem igjen. Det meste skal fungere som på Jupyterthub.

3) Få hjelp om du ikke får det ti...

Publisert 8. des. 2017 12:14

For de som ikke er vant til et 'windows' tastatur: legg merke til at man trenger tasten merket 'Alt Gr' i kombinasjon med 7, 8, 9 og 0 tastene for å få {} og []. Se et bildet av tastaturet.

Publisert 6. des. 2017 17:13

Pensum for eksamen er kapittel 1-7 fra boken, med all python som blir behandlet i de kapitlene.

Husk cheat sheet, som blir delt ut på eksamen i papirform, som dekker det meste av python.

Publisert 1. des. 2017 14:06

Informasjon om digital skoleeksamen ved UiO finner du her:

http://www.uio.no/studier/eksamen/inspera-skole/index.html

 

Publisert 24. nov. 2017 10:10

Kjære studenter i BIOS1100,

Undervisning i emne er nå avsluttet, og bare eksamen gjenstår for dere. Her er en liten oversikt over ressurser som er tilgjengelig som kan hjelpe dere med å forberede dere til eksamen:

- orakeltime torsdag 30. november kl. 13:00 - 16:00 i rom 3127 (datalabben): få hjelp med dine siste spørsmål om stoffet eller oppgaver elelr andre ting dere lurer på.
-  alle flervalgsspørsmål (mentimeter) fra både forelesning og gruppetimene ligger ute, med svarene og en forklaringen, ligger her
- prøveeksamen er åpnet igjen, logg deg inn på https://uio.inspera.no da dukker det opp der
- mengdetreningsøvelser med trix
- cheat sheet, huskelapp for programmering i Python. Denne deles også ut (på papir) på eksamen! Sjekk...

Publisert 22. nov. 2017 12:51

Det blir orakeltime torsdag 30. november kl. 13:00 - 16:00 i rom 3127 (datalabben): få hjelp med dine siste spørsmål om stoffet eller oppgaver, .... Det er ingen undervisnings opplegg, men 5 gruppelærere er til stedet, og kanskje stikker emneansvarlig innom også.

Velkommen skal dere være!

Publisert 17. nov. 2017 16:05

Det har vært etterspurt en gjennomgang av kapittel 8 og 9, som ble kuttet fra pensum. Gruppelærer Thomas Grefsrud tilbyr seg å gå gjennom noe av det på tirsdag 21. november fra kl 9:15 på rom 3127. Dette er IKKE pensum for eksamen og deltakelse er helt frivillig. Hvis noen har ønsker om spesifikke deler av kapitlene kan dere sende Thomas en mail på thomahg@ifi.uio.no. Foreløpig har han fått ønsker om kapittel 9. Dette kapittelet har noe kule sykdomsspredningsmodeller...

Husk at PDF og notebook for kapittel 8 og 9 er tilgjengelig på Jupyterhub (mappene 'uke12' og 'uke13+14')

Takk, Thomas, for at du gjør dette!

Publisert 17. nov. 2017 14:27

Se dette bildet for gjenglemte saker vi fant i 312, bl.a. tre laptopladere (2 x MAC, 1 x ASUS). Kan hentes på gruppeundervisningen neste torsdag&fredag 10:15-14:30.

 

Publisert 16. nov. 2017 14:51

Aller siste leveringsfrist for obliger er tirsdag 21. november kl. 23:59. Du får nå bare levere obliger fra de siste tre ukene, 10, 11 og 12.

Husk at du må ha bestått minst 7 obliger for å kunne gå opp til eksamen!

Hvis en av disse obliger ikke er åpen for levering i din Devilry, send en e-post til bios1100@ibv.uio.no med ditt navn og hvilke oblig(er) det gjelder, så skal vi åpne for deg.

Publisert 9. nov. 2017 09:20

Vi har fått tilgang til mengdetreningsøvelser fra Institutt for Informatikk. De som kan brukes i BIOS1100 er tagget med kurskoden.

Se informasjon på denne siden for hva, hvor, og hvordan.

Publisert 7. nov. 2017 08:42

Oblig for kursuke 12, med frist 14. november, er den siste obligen. Denne får du bestått uansett hva du leverer, men du må levere noe, eventuelt en tom notebook.

Husk oblig for kursuke 11 med frist i dag.

Siste frist for å levere ikke-godkjente obliger er tirsdag 21. November 23:59. Husk at du må ha minst 7 obliger godkjent for å kunne gå opp til eksamen.

Publisert 7. nov. 2017 08:39

Prøveeksamen er tilgjengelig til og med neste uke. Logg deg inn på https://uio.inspera.no da dukker det opp der.

Ikke send inn eksamen når du er ferdig, da mister du tilgang til den.

Fasit legges ut snart på Jupyterhub.

 

Publisert 6. nov. 2017 12:05

Noen studenter har etterspurt om de kunne få tilgang til resten av pensumet. Jeg har lagt ut kapittel 9 på Jupyterhub, som vanlig både som PDF og notebook, i mappen 'uke13+14'. Kapittel 8 ligger i mappen 'uke12'.

en PDF av hele boken er også lagt ut i BIOS1100 mappen.

OBS kapittel 8 og 9 er ikke pensum for eksamen! Se tidligere beskjed om dette.

Publisert 2. nov. 2017 13:39

Kjære studenter i BIOS1100,

Jeg har skjønt at, mens en del av dere klarer seg fint, en betydelig del av dere synes stoffet i BIOS1100 er vanskelig, og føler at dere ikke mestrer det. Jeg har bestemt meg for å gjøre noe med dette og skal derfor tilpasse undervisningen i de tre siste ukene. Målet er å sørge for at flere av dere føler mestring i dette emnet og at dere føler dere trygge på at eksamen er noe dere klarer. 

Konkret betyr det at vi ikke skal ha noe nytt pensum. Kapittel 8 og 9 faller bort, den delen av kapittel 8 som ble behandlet i kursuke 9 blir ikke en del av eksamen. I tillegg avsluttes den ordinære gruppeundervisningen. Det blir fortsatt obligatoriske innleveringer for uke 12 og 13, se http://www.uio.no/studier/emner/matnat/ibv/BIOS1...

Publisert 31. okt. 2017 16:49

Sjekk ut første versjon av 'coding cheat sheet' - deres huskelapp for programmering i Python.

http://www.uio.no/studier/emner/matnat/ibv/BIOS1100/h17/ressurser/hovedside.md, then 'Coding cheat-sheet’

Den endelige versjonen kommer til å bli delt ut på eksamen, og kan brukes som hjelpemiddel under selve eksamen.

Publisert 27. okt. 2017 13:38

I oblig'en for uke 10 står det

b) You may not have gotten the bases in the same order as above and this is expected behavior. What does that tell you about the order of the keys in a Python dictionary?

Det har oppstått noe forvirring rundt dette.

Dette refererer til at nøklene ('keys') i en Python dictionary ikke har en fastsatt rekkefølge. Det vil si at når man går over alle nøkler i en løkke, forskjellige personer, selv om de kjører den samme koden, kan få nøklene i en annen rekkefølge.

Oppgave a) sier:

Make a new dictionary called bases so that you can use it to obtain this output:
    Thymine is abbreviated as T
    Guanine is abbreviated as G
    Adenine is abbreviated as A
    Uracil is abbreviated as U
    Cytosine is abbreviated as C

Det var ikke meningen at re...

Publisert 26. okt. 2017 14:33

Kjære BIOS1100 studenter, 

Det er viktig for oss å vite hva dere mener om BIOS1100. Vi setter pris på om dere kan ta et par minutter til å svare på dette: https://nettskjema.uio.no/answer/88731.html 

Takk!
 

Publisert 16. okt. 2017 10:56

Vi har fått klager fra de ansatte som har kontor i gangen utenfor grupperommet/datalabben 3127 om bråk i pausene.

Vennligst respekter deres behov for arbeidsro og ikke lag unødvendig støy i gangene.

Publisert 12. okt. 2017 07:51

De neste ukene behandler vi følgende (del)kapitler fra boken:

  • uke 9 (42) kapittel 8.3 Restriction Digestion (resten av kap. 8 kommer i uke 12)
  • uke 10 kapittel 7 til og med 7.4 Counting GC content
  • uke 11 kapittel 7 fra og med 7.5 Transcription of DNA to mRNA
  • uke 12 kapitel 8 (utenom 8.3)

På Jupyterhub finnes disse mappene:

  • uke09 - med kap. 8.3
  • uke10+11 - med kap. 7
  • uke12 - med (hele) kap. 8
     
Publisert 9. okt. 2017 10:41

For å teste deg selv kan du nå gå gjennom alle flervalgsspørsmål (mentimeter) fra både forelesning og gruppetimene. Svarene og en forklaringen er med, men de er skjult og vises ikke til du klikker på det lille 'hånd' symbolet.

Spørsmålene finner du på denne siden.

Spørsmål fra resten av kurset blir lagt til fortløpende.

Husk at enhver av disse, eller en variant, kan bli eksamenspørsmål!

 

Minner også om ekstra snublegrupper denne uken.

Publisert 3. okt. 2017 09:52

Vi deler ut en liten pris til den mest kreative Turtle tegningen i Jupyter Notebook!

  • bruk Jupyter Notebook for å lage en 'Turtle' tegning
  • send din turtle tegning som notebook til bios1100@ibv.uio.no
  • den mest kreative tegning får en pris!
  • (gruppe)lærere er juryen
  • kodekvalitet er ikke viktig
  • frist for innsending: fredag 6. oktober kl. 23:59
  • bruk ditt navn i filnavn (eller i notebooken)

Vinnertegningen blir annonsert i forelesningen mandag 16. oktober.

Lykke til!

Publisert 3. okt. 2017 07:48

Uke 41 (kursuke 8) er undervisningsfri uke. Det blir ingen forelesning, men vi tilbyr følgende utvidede snublegrupper:

 

  • tirsdag 10. oktober kl 10:15-14:00 seminarrom 3508
  • torsdag 12. oktober kl 10:15-14:00 seminarrom 4619

Disse kommer i stedet for de vanlige snublegruppen.