I MonoMyx ønsker vi å undersøke tilsammen 300 fisk for begge grupper av parasitter. Alle parasitter vil bli identifisert og bestemt morfologisk før de deretter blir DNA-strekkodet (DNA-sekvensering av egnede markører). DNA-strekkoding vil bli gjort på alle arter som er, eller antas å være, nye for vitenskapen i tillegg til de som er nye registreringer for Norge. Arter som ikke er nye for Norge, men som det ikke finnes DNA-sekvenser for, vil også bli strekkodet.
Mer info om MonoMyx-prosjektet hos Artsdatabanken
- I forbindelse med MonoMyx-prosjektet og andre pågående forskningsprosjekter kan vi tilby masteroppgaver med fokus på problemstillinger innen systematikk, fylogeni, co-evolusjon for en rekke forskjellige vert-parasitt-systemer.
- Prosjektet inneholder mange mulige problemstillinger og vert-parasitt-systemer som kan studeres. Innholdet og fokus kan tilpasses den enkelte studentens ønsker.
- Studentene vil lære både molekylære og morfologiske teknikker i tillegg til feltarbeid og vil samarbeide med forskere ved flere forskjellige institusjoner.
- Metodikken for studere de fleste parasittene er tilgjengelig slik at oppgavene skal kunne gjennomføres innen tidsfristen. Hvis studentene ønsker kan det også legges inn metodeutvikling.
- Alle oppgavene vil planlegges slik at de skal resultere i en vitenskapelig publikasjon.
Veiledere: Haakon Hansen, Veterinærinstituttet, Egil Karlsbakk, Havforskningsinstituttet og UiB,, Dag Klaveness, UiO.
Eksempler på oppgaver/problemstillinger tilknyttet MonoMyx-prosjektet.
Monogenea
Gyrodactylus på flatfisk (Pleuronectidae, Scopthalmidae, Soleidae).
- Ukjent biodiversitet og nye arter?
- Co-evolusjon eller host-switch? Sammenligne gyro-fylogeni og vertsfylogeni.
Genetisk diversitet innen slekten Calicotyle og arten Calicotyle kroeyeri hos nordøst-Atlantiske Rajidae.
- Denne parasitten er funnet på mange arter (euryxene), men det er gjort få molekylærgenetiske studier.
Molekylær systematikk av Gyrodactylus-arter på rognkjeks, Cyclopterus lumpus
- Rognkjeks brukes i dag som rensefisk innen norsk lakseoppdrett og skal med dette bidra til å bedre fiskehelse, men den er også selv infisert av en rekke parasitter.
- Parasitter i slekten Gyrodactylus er funnet på rognkjeks i flere lokaliteter og vi har allerede prøver fra flere av disse lokalitetene.
- Studenten vil sammenligne prøver fra flere lokaliteter vha. DNA-sekvensering og morfologi.
Diversitet innen Gyrodactylus hos Gobiidae (Pomatoschistus spp., Gobiusculus og Gobius).
- En del er kjent, men sannsynligvis fortsatt mye ukjent.
- Co-evolusjon eller host-switch? Sammenligne gyro-fylogeni og vertsfylogeni.
- Lett å få tak i materiale: strandnot
Co-evolusjon i slekten Diclidophora som infiserer torskefisk
- Disse parasittene er antatt å være vertsspesifikke, men molekylært er lite gjort.
- Co-evolusjonsstudier basert på 28S ribosomalt og mitokondrielt COI.
Myxozoa:
Fylogeni innen familien Parvicapsulidae (Myxozoa)
- I denne gruppen parasitter finner vi blant annet arter som skaper store problemer i norsk lakseoppdrett (se her for mer info).
- Fylogenien til denne gruppene er ikke klarlagt og vi har materiale fra mange forskjellige arter og isolater tilgjengelig for dette studiet.
- Studenten vil DNA sekvensere LSU (large subunit ribosomal DNA) fra isolater av artene i denne gruppen og utlede fylogenien basert på dette.
Diversitet av slekten Chloromyxum i elasmobrancher.