Pensum/læringskrav (INF4350 - Høst 2011) Jin Xiong: Essential Bioinformatics, 2006. Cambridge University Press. ISBN: 0-521-60082-0. chapter 1-15,17.
Sean Eddy: What is dynamic programming?, 2004. Nature Biotechnology, 22, 909-911. Fulltekst. All lecture handouts, all exercises and both partial exams| Dato | Undervises av | Sted | Tema | Kommentarer / ressurser |
| 24.08.2011 | Ole Christian Lingjærde | Introduksjon | ||
| 31.08.2011 | Anja Bråthen Kristoffersen | Parvis sammenstilling | Kap. 3 og "What is dynamic programming?" | |
| 07.09.2011 | Anja Bråthen Kristoffersen | Scoringmatriser og heuristiske sammenstillingsprogrammer | Kap 3 og 4 | |
| 14.09.2011 | Anja Bråthen Kristoffersen | Multippel sammenstilling | Kap 5 | |
| 21.09.2011 | Anja Bråthen Kristoffersen | Profiler og HMM | Kap 6 og 7 | |
| 28.09.2011 | Anja Bråthen Kristoffersen | Genprediksjon | Kap 8 og 9 | |
| 05.10.2011 | Ingen undervisning (høstferie) | |||
| 12.10.2011 | Ole Christian Lingjærde | Transkripsjon | Kap 18. Det blir gruppeøving denne uken. Forelesningen starter 10.15 med 15 minutter om gensøk først. | |
| 19.10.2011 | Ole Christian Lingjærde | Mikromatriser (1) | Kap 18. Hel-genom måling av transkripsjon | |
| 26.10.2011 | Jon K. Lærdahl | Proteinstruktur 1 | kap 12-15 | |
| 02.11.2011 | Jon K. Lærdahl | Proteinstruktur 2 | kap 12-15 | |
| 09.11.2011 | Ole Christian Lingjærde | Mikromatriser (2) | Kap 18. Gjennomføring og analyse av mikromatriseforsøk. Bruk av mikromatriser til å måle genomisk kopitall. Analyse av kopitalldata. | |
| 16.11.2011 | Ole Christian Lingjærde | Analyser av SNP data | ||
| 23.11.2011 | Ole Christian Lingjærde | Fylogenetiske analyser | ||
| 30.11.2011 | Ole Christian Lingjærde | Oppsummering |