BIOS3010 – Bioinformatikk
Beskrivelse av emnet
Kort om emnet
Dagens molekylærbiologiske metoder produserer datamengder som krever spesielle beregningsverktøy for å kunne forstås og analyseres. Disse gjør det mulig å angripe problemer innen livsvitenskapene som inntil nylig ble ansett som uløselige. I dette emnet lærer du om sentrale temaer, teorier og verktøy i bioinformatikk, samt å bruke disse til å sammenlikne og analysere biologiske datasett.
Hva lærer du?
Etter å ha tatt dette emnet
- kan du sammenlikne sekvenser av nukleotider og aminosyrer for å gi funksjonell og evolusjonær informasjon
- kan du analysere og visualisere proteinstrukturer
- kan du bruke enkel programmering til å implementere algoritmer relevant for bioinformatikk
- kan du gjøre enkle analyser av datasett fra dypsekvenseringsteknologier
- kan du diskutere og vurdere bruken av metoder for sekvens- og strukturanalyse
- kan du gjøre rede for de teoretiske og statistiske prinsippene som ligger til grunn for sekvens- og strukturanalyse
Opptak til emnet
Studenter må hvert semester søke og få plass på undervisningen og melde seg til eksamen i Studentweb.
Prioritet vil bli gitt til studenter på bachelorprogrammet i biovitenskap.
Spesielle opptakskrav
I tillegg til generell studiekompetanse eller realkompetanse må du dekke spesielle opptakskrav.
Du må ha:
- Matematikk R1 (eller Matematikk S1 + S2)
Og en av disse:
- Matematikk R2
- Fysikk (1+2)
- Kjemi (1+2)
- Biologi (1+2)
- Informasjonsteknologi (1+2)
- Geofag (1+2)
- Teknologi og forskingslære (1+2)
Matematikk R2 var et krav til og med studieåret 2021/2022 som del av en forsøksordning. Fra og med studieåret 2022/2023 er det ikke lenger et krav med matematikk R2.
De spesielle opptakskravene kan også dekkes med fag fra videregående opplæring før Kunnskapsløftet, eller på andre måter. Les mer om spesielle opptakskrav.
Obligatoriske forkunnskaper
Elementære forkunnskaper i programmering, tilsvarende innholdet i BIOS1100 – Innføring i beregningsmodeller for biovitenskap.
Anbefalte forkunnskaper
BIOS1110 – Celle- og molekylærbiologi og STK1000 – Innføring i anvendt statistikk
Overlappende emner
- 8 studiepoeng overlapp med MBV3070 – Bioinformatikk (nedlagt).
- 6 studiepoeng overlapp med IN4030 – Introduksjon til bioinformatikk.
Undervisning
- Forelesninger
- Organisert øving i gruppe med hjelpelærer (Obligatorisk de første fire ukene)
- Selvstendig gruppearbeid med obligatoriske innleveringer der en hjelpelærer er tilgjengelig (Obligatorisk oppmøte de første fire ukene).
Det er obligatorisk oppmøte til første forelesning for studenter som skal følge undervisning i emnet. Dette gjelder også for studenter på venteliste. Du mister plassen på emnet dersom forfall til første forelesning ikke er meldt til studieseksjonen studieinfo@ibv.uio.no, før forelesningen starter.
Godkjente obligatoriske elementer er gyldige i 3 år.
Adgang til undervisning: Dersom du har gjennomført og fått godkjent obligatorisk undervisning, har du ikke krav på ny undervisning. Dersom du har fått undervisningsopptak til emnet, men ikke har gjennomført eller fått godkjent obligatorisk undervisning, har du rett til ny undervisning når det er ledig kapasitet.
Eksamen
- Avsluttende skriftlig eksamen som teller 100% ved sensurering.
Obligatoriske oppgaver må være godkjent og obligatoriske oppmøter må være gjennomførte for å kunne gå opp til eksamen.
Godkjente obligatoriske elementer er gyldige i 3 år.
Eksamensforsøk: Som eksamensforsøk i dette emnet teller også forsøk i følgende tilsvarende emne: MBV3070 – Bioinformatikk (nedlagt)
Hjelpemidler til eksamen
Ingen hjelpemidler er tillatt.
Eksamensspråk
Du kan besvare eksamen på norsk, svensk, dansk eller engelsk.
Karakterskala
Emnet bruker karakterskala fra A til F, der A er beste karakter og F er stryk. Les mer om karakterskalaen.
Adgang til ny eller utsatt eksamen
Dette emnet tilbyr både utsatt og ny eksamen. Les mer:
Mer om eksamen ved UiO
- Kildebruk og referanser
- Tilrettelegging på eksamen
- Trekk fra eksamen
- Syk på eksamen / utsatt eksamen
- Begrunnelse og klage
- Ta eksamen på nytt
- Fusk/forsøk på fusk
Andre veiledninger og ressurser finner du på fellessiden om eksamen ved UiO.