KJM5631 – Multi-skala molekylmodellering
Kort om emnet
Emnet skal gi studenter i kjemi og tilgrensende fagområder innføring i molekylmodellering til bruk i kjemien. Det legges stor vekt på praktisk anvendelse. Samtidig skal studentene få god forståelse av metodene, også utover det rent operasjonelle. Målet er å gi studentene grunnlag for selvstendighet å vurdere valg av metoder og påliteligheten av resultatene.
Hva lærer du?
Etter å ha fullført emnet kan du
- Forklare den teoretiske sammenhengen mellom statistisk mekanikk, kvantemekanikk og datamodellering.
- Forklare hvordan makroskopiske termodynamiske størrelser, inkludert frienergiprofiler og reaksjonshastigheter, kan utledes fra mikroskopiske mekaniske egenskaper.
- Beskrive hvordan molekylære modeller i ulike skalaer og oppløsninger kan brukes til å beskrive ulike (bio)kjemiske og (bio)fysiske fenomener.
- Beskrive og bruke de grunnleggende algoritmene som brukes i molekylmodellering, inkludert molekyldynamikk, samt mer avanserte forbedrede prøvetakingsteknikker.
- Diskutere styrker og svakheter ved forskjellige modeller, inkludert ab initio, molekylmekanikk, QM/MM, grovkornede modeller og mesoskalamodeller.
- Vurdere nøyaktigheten av utførte beregninger.
- Presentere resultater fra beregningsstudier i både muntlig og skriftlig form.
Opptak til emnet
Studenter tatt opp til andre masterprogrammer kan, etter søknad, få adgang til emnet hvis dette er klarert med eget program.
Dersom du ikke allerede har studieplass ved UiO, kan du søke om opptak til våre studieprogrammer, eller søke om å bli enkeltemnestudent.
Anbefalte forkunnskaper
KJM2601 – Fysikalsk kjemi II - kvantekjemi og spektroskopi, KJM3300 – Fysikalsk kjemi II (nedlagt), MAT1050 – Matematikk for anvendelser 1, MAT1060 – Matematikk for anvendelser 2, IN-KJM1900 – Introduksjon i programmering for kjemikere eller tilsvarende emner.
Undervisning
Emnet går over et semester. Undervisningen består av:
- 30 timer forelesninger og
- 32 timer datalab (åtte øvelser/rapporter).
For å gå opp til eksamen må du ha fått godkjent samtlige åtte rapporter. En av øvelsene skal du i tillegg presentere muntlig. Presentasjonen må være godkjent.
Godkjente presentasjoner og rapporter er bare gyldig det semesteret de blir godkjent.
Det er obligatorisk oppmøte til første forelesning og første gruppetime (gjelder også hvis du står på venteliste). Du mister plassen på emnet dersom gyldig forfall til første forelesning/gruppetime ikke er meldt til Kjemisk institutt, før forelesningen/gruppen starter.
Eksamen
- Tre skriftlige deleksamener i form av innleveringsoppgaver teller tilsammen 50 % av avsluttende vurdering. Du får beskjed i starten av semesteret hvilke rapporter som teller med i vurderingen.
- Avsluttende muntlig eksamen teller 50 % ved sensurering.
Dette emnet har obligatoriske øvelser som må være godkjent før avsluttende eksamen
Som eksamensforsøk i dette emnet teller også forsøk i følgende tilsvarende emne: KJM9631 – Multi-skala molekylmodellering
Karakterskala
Emnet bruker karakterskala fra A til F, der A er beste karakter og F er stryk. Les mer om karakterskalaen
Adgang til ny eller utsatt eksamen
Studenter som dokumenterer gyldig fravær fra ordinær eksamen, kan ta utsatt eksamen i starten av neste semester.
Det tilbys ikke ny eksamen til studenter som har trukket seg under ordinær eksamen, eller som ikke har bestått.
Mer om eksamen ved UiO
- Kildebruk og referanser
- Tilrettelegging på eksamen
- Trekk fra eksamen
- Syk på eksamen / utsatt eksamen
- Begrunnelse og klage
- Ta eksamen på nytt
- Fusk/forsøk på fusk
Andre veiledninger og ressurser finner du på fellessiden om eksamen ved UiO.