BIOS3011 – Bioinformatikk i prosjektgrupper

Etter å ha tatt dette emnet

• Kan du samarbeide om utvikling av kode i grupper ved bruk av verktøy og metoder for versjonskontroll og deling av kode
• Kan du forklare og diskutere egen og andres bioinformatikk-kode
• Kan sammenstille og analysere nukleotid- og aminosyresekvenser for å gi grunnleggende funksjonell og evolusjonær informasjon
• Kan du forklare de teoretiske og statistiske prinsippene som ligger til grunn for biologisk sekvensanalyse og vanlige algoritmer i bioinformatikk
• Kan du bruke programmering til å implementere grunnleggende algoritmer og verktøy relevante for bioinformatikk
• Kan du sette opp bioinformatiske arbeidsflyter (pipelines) av begrenset omfang ved hjelp av systemer for arbeidsflythåndtering
• Kan du utføre enkle analyser og tolke datasett fra dypsekvenseringsteknologier

Studenter må hvert semester søke og få plass på undervisningen og melde seg til eksamen i Studentweb.

Prioritet vil bli gitt til studenter på bachelorprogrammet i biovitenskap.

I tillegg til generell studiekompetanse eller realkompetanse må du dekke spesielle opptakskrav.

Du må ha:

• Matematikk R1 (eller Matematikk S1 + S2)

Og en av disse:

• Matematikk R2
• Fysikk (1+2)
• Kjemi (1+2)
• Biologi (1+2)
• Informasjonsteknologi (1+2)
• Geofag (1+2)
• Teknologi og forskingslære (1+2)

Matematikk R2 var et krav til og med studieåret 2021/2022 som del av en forsøksordning. Fra og med studieåret 2022/2023 er det ikke lenger et krav med matematikk R2.

De spesielle opptakskravene kan også dekkes med fag fra videregående opplæring før Kunnskapsløftet, eller på andre måter. Les mer om spesielle opptakskrav.

• Forelesninger med live-koding
• Organisert øving i gruppe med hjelpelærer (obligatorisk de første to ukene)
• Selvstendig gruppearbeid med obligatoriske innleveringer der en hjelpelærer er tilgjengelig (obligatorisk oppmøte de første to ukene)

Obligatoriske aktiviteter må være godkjent for å kunne gå opp til eksamen.

Det er obligatorisk oppmøte til første forelesning for studenter som skal følge undervisning i emnet. Dette gjelder også for studenter på venteliste. Du mister plassen på emnet dersom forfall til første forelesning ikke er meldt til studieseksjonen studieinfo@ibv.uio.no, før forelesningen starter.

Adgang til undervisning: Dersom du har gjennomført og fått godkjent obligatorisk undervisning, har du ikke krav på ny undervisning. Dersom du har fått undervisningsopptak til emnet, men ikke har gjennomført eller fått godkjent obligatorisk undervisning, har du rett til ny undervisning når det er ledig kapasitet.

• 2 gruppevise innleveringer (må være godkjent for å gå opp til eksamen)
• Skriftlig eksamen midt i semesteret som teller 50 % ved sensurering
• Avsluttende muntlig eksamen, basert på innlevering i forkant, som inneholder både en gruppepresentasjon/eksaminasjon som teller 25 % ved sensurering og en individuell presentasjon/eksaminasjon som teller 25 % ved sensurering.

Studenter som dokumenterer gyldig fravær fra ordinær eksamen, kan ta utsatt eksamen i starten av neste semester.

Det tilbys ikke ny eksamen til studenter som har trukket seg under ordinær eksamen, eller som ikke har bestått.