Prosjektene i Horisont Europa og Horisont 2020 skal regnskapsførers som alle andre eksternt finansierte prosjekter ved UiO, men Grant Agreement inneholder særlige bestemmelser rundt økonomi som skal følges. Ved rapportering må Grant Agreements bestemmelser for dokumentasjonskrav og beregninger av personalkostnader legges til grunn. Dette medfører at kostnadene som rapporteres til EU-kommisjonen ikke nødvendigvis stemmer overens med de regnskapsførte kostnadene når det kommer til personalkostnader.
Marie Skłodowska Curie og rundsumprosjekter har en avvikende praksis ved rapportering, og behandles separat.